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纖維素酶的生產工藝主要有兩種，即固體發酵和液體發酵，其工藝如下：

影響產酶量和活力的因素

影響纖維素酶產量和活力的因素很多，除菌種外，還有培養溫度、pH、水分、基質、培養時間等。這些因素不是孤立的，而是相互聯系的。張中良等（1997）采用均勻設計Cl12(1210)，以綠色木霉（T.ViriclePers.expr）為菌種，研究了影響產纖維素酶的五大因素對產酶量和活力的作用，認為基質粗纖維含量為40%、初始pH7.5、加水4倍、在26-31℃條件下培養45h可獲得產酶量26mg/g和CMC酶活力20mg/g·h。王成華等（1997）也研究了其誘變篩選的里氏木霉91-3的產酶條件，結果表明該菌種以7：3的秸稈粉和麥麩，另添加4%硫酸銨、0.4%磷酸二氫鉀、0.1%硫酸鎂為培養基，28-32℃為適宜培養溫度，30℃為最佳溫度，4%為接種量，96h到達發酵高峰。張苓花等（1998）研究了以康氏木霉W-925為出發菌，經誘變后得到的Wu-932纖維素酶高產菌的發酵條件。結果表明，以1：2的麥麩和稻草粉為培養基，5%的接種量，稻草粉碎平均長度3-5mm，初始pH4-5，溫度在28-35℃，發酵時間72h為發酵條件。

污染菌的控制

飼用纖維素酶普遍存在一種俗稱的“白毛菌”污染。污染后輕者酶活性下降，重者發酵失敗。為此，研究控制發酵污染意義很大。張苓花等（1998）研究“白毛菌”的菌落特征、來源、生長和生理特征及控制方法，找到了一種與康氏木霉Wu-932呈共生關系，而與“白毛菌”呈競爭性抑制關系的熱帶假絲酵母菌J-931。利用此菌進行混合發酵，可有效地控制“白毛菌”的污染。