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自然界中低聚異麥芽糖極少以游離狀態存在，但作為支鏈淀粉或多糖的組成部分，在某些發酵食品如醬油、黃酒或酶法葡萄糖漿中有少量存在。 工業上以淀粉為原料生產低聚異麥芽糖需要一種酶，此酶為α-葡萄糖苷酶，又名葡萄糖基轉移酶，簡稱α-糖苷酶。它能切開麥芽糖和麥芽低聚糖分子結構中α-1，6糖苷鍵，并能將游離出來的一個葡萄糖殘基轉移到另一個葡萄糖分子或麥芽糖或麥芽三糖等分子中的α-1，6位上，形成異麥芽糖、異麥芽三糖、異麥芽四糖、異麥芽五糖和潘糖等。

低聚異麥芽糖（IMO）又稱為異麥芽低聚糖、異麥芽寡糖、分枝低聚糖等，我國輕工行業標準定為低聚異麥芽糖。它是淀粉糖的一種，主要成分為葡萄糖分子間以α-1 ，6糖苷鍵結合的異麥芽糖、潘糖、異麥芽三糖及四糖以上的低聚糖。國內外學者對低聚異麥芽糖（IMO）所包含糖的種類，其說法略有出入。但國內外學者普遍共識必須包括異麥芽糖、潘糖、異麥芽三糖，它是體現低聚異麥芽糖（IMO）功能性的主要成分，其含量高低反映了產品質量的好壞，也影響產品的價格和應用前景。

低聚異麥芽糖在自然界中其作為支鏈淀粉或多糖的組成部分。在某些發酵食品如醬油，黃酒中僅有少量存在。由于其可促使人體內的雙歧桿菌增殖，具水溶性膳食纖維功能，熱值低、等特性，所以是種應用廣泛的功能性低聚糖，市面上異麥芽低聚糖產品主要有立健這類的養腸保健品。